免疫净化
主要用于DMARDs治疗效果不佳的患者，目前国内开展的免疫净化有免疫吸附和双膜血浆过滤。血浆净化通过去除有害抗体和循环免疫复合物发挥疗效，它对难治性RA疗效肯定。但是，必须配合有效的DMARDs联合治疗，才能达到病情长期缓解的目的。
双膜过滤的原理是：病人血液通过第一层膜时，有形成分和血浆分离，然后使血浆通过第二层膜，将大分子物质（主要是免疫球蛋白和免疫复合物）与其余血浆分离，最后弃去大分子物质，将其余血浆和有形成分回输给病人。
免疫吸附方法是让病人血液通过一个挂有葡萄球菌蛋白A（SpA）的层析柱。 SpA是大部分金黄色葡萄球菌细胞壁中都有的一种蛋白质成分，1分子SpA可以和多个IgG分子结合，提示它含有多个类似的结构。现在已经能够应用基因工程的办法生产SpA。SPA免疫吸附治疗除此以外，似乎还通过其他多种机制发挥疗效，而且在不同的疾病各有侧重。SPA治疗RA效果显著，不良事件发生少。
造血干细胞移植（HSCT）
多项试验结果表明，自体干细胞移植治疗可使多数RA获得缓解，达到ACR50标准。尽管它并不能治愈RA, 但复发后应用移植前无效的DMARDs即可再次缓解。因此对于传统治疗方法，甚至最新的以TNF-α拮抗剂为代表的生物治疗都无反应，病情持续进展的难治性RA来说，造血干细胞移植（HSCT）仍不失为一种很有希望的治疗措施。
目前认为，HSCT诱导RA缓解的机理包括以下几个方面：（1）RA的发病需要多种及多亚群的淋巴细胞参与抗原的递呈、识别和反应，而预处理方案的应用使这些细胞功能发生障碍，甚至凋亡, 即摧毁了自我攻击性淋巴细胞克隆，从而抑制了炎症反应，起到使疾病短期缓解的作用；（2）通过祛除移植物中的淋巴细胞，尽可能减少移植物中异常的淋巴细胞克隆，最大限度地减低T细胞激活所造成的异常免疫功能状态，降低复发的可能；（3）HSCT后免疫重建是疾病长期缓解的基础。免疫重建一般发生于移植后半年，主要为细胞免疫的重建，淋巴细胞各亚群的重建不同步，B淋巴细胞约于移植后6~12个月恢复，而T淋巴细胞需1~2年才能恢复正常，如CD4/CD8淋巴细胞比例倒置可持续至移植后2年。在免疫重建过程中，患者的免疫调节可能达到新的平衡或产生免疫耐受，即对自身抗原决定无反应性和/或反应程度的下降，使RA得以控制甚至治愈。RA患者在接受HSCT后,已破坏的关节在免疫重建中提供新的抗原,能通过负选择而产生免疫耐受。但由于RA的病因并不是单因素的，骨髓的微环境及生存的环境未改变, RA仍有复发的可能，HSCT后病情的复发可能还有以下原因：自身攻击的淋巴细胞克隆继续存活；自身反应的淋巴细胞克隆再回输；患者原有自身抗原的持续刺激等。这些问题的解决尚有待于更深更广的研究。
近年来基础免疫学研究进展使得精确抑制异常免疫反应的某个环节成为可能，生物制剂治疗风湿病也成为近十年来风湿病治疗最重要的进展之一。但免疫反应本身是一个复杂的网络，应用生物制剂后会对免疫系统的整体产生复杂的影响，因此会出现一些传统免疫抑制剂没有的新问题。
